Evolusi epidemiologi dan dinamika transmisi penyakit coronavirus 2019 di luar provinsi Hubei, Cina: studi deskriptif dan pemodelan Artikel sebelumnya Dari Cina: harapan dan pelajaran untuk kontrol COVID-19
Jumat, 03 April 2020
Ringkasan
Latar Belakang
Epidemi penyakit coronavirus 2019 (COVID-19), yang disebabkan oleh coronavirus 2 sindrom pernapasan akut (SARS-CoV-2), dimulai di kota Wuhan, provinsi Hubei, pada bulan Desember, 2019, dan telah menyebar ke seluruh Tiongkok. Memahami epidemiologi yang berkembang dan dinamika transmisi wabah di luar Hubei akan memberikan informasi yang tepat waktu untuk memandu kebijakan intervensi.
Metode
Kami mengumpulkan informasi individual dari sumber publik resmi tentang kasus yang dikonfirmasi laboratorium yang dilaporkan di luar Hubei di daratan Cina untuk periode 19 Januari hingga 17 Februari 2020. Kami menggunakan tanggal revisi keempat definisi kasus (27 Jan) untuk membagi epidemi menjadi dua periode waktu (24 Desember - 27 Jan, dan 28 Jan - 17 Februari) sebagai tanggal timbulnya gejala. Kami memperkirakan tren dalam karakteristik demografis kasus dan interval waktu-ke-peristiwa utama. Kami menggunakan pendekatan Bayesian untuk memperkirakan dinamika jumlah reproduksi bersih (Rt) di tingkat provinsi.
Temuan
Kami mengumpulkan data pada 8579 kasus dari 30 provinsi. Usia rata-rata kasus adalah 44 tahun (33-56), dengan peningkatan proporsi kasus pada kelompok usia yang lebih muda dan pada orang tua (yaitu, usia> 64 tahun) ketika epidemi berkembang. Waktu rata-rata dari onset gejala sampai masuk rumah sakit menurun dari 4 · 4 hari (95% CI 0 · 0–14 · 0) untuk periode 24 Desember hingga 27 Januari, menjadi 2 · 6 hari (0 · 0–9 · 0 ) untuk periode 28 Januari hingga 17 Februari. Masa inkubasi rata-rata untuk seluruh periode diperkirakan 5 · 2 hari (1 · 8-12 · 4) dan interval serial rata-rata pada 5 · 1 hari (1 · 3– 11 · 6). Dinamika epidemi di provinsi di luar Hubei sangat bervariasi tetapi secara konsisten mencakup campuran impor kasus dan transmisi lokal. Kami memperkirakan bahwa epidemi itu bertahan sendiri selama kurang dari 3 minggu, dengan rata-rata Rt mencapai puncak antara 1 · 08 (95% CI 0 · 74-1 · 54) di kota Shenzhen di provinsi Guangdong dan 1 · 71 (1 · 32) –2 · 17) di provinsi Shandong. Di semua lokasi di mana kami memiliki cakupan data Rt yang cukup, Rt diperkirakan berada di bawah ambang epidemi (yaitu, <1) setelah 30 Januari.
Penafsiran
Perkiraan kami tentang periode inkubasi dan interval serial serupa, menunjukkan puncak awal infeksi, dengan kemungkinan penularan sebelum timbulnya gejala. Hasil kami juga menunjukkan bahwa, ketika epidemi berkembang, individu yang terinfeksi lebih cepat diisolasi, sehingga memperpendek jendela penularan di masyarakat. Secara keseluruhan, temuan kami menunjukkan bahwa tindakan pencegahan yang ketat, pembatasan gerakan, dan peningkatan kesadaran penduduk mungkin telah berkontribusi untuk mengganggu transmisi lokal SARS-CoV-2 di luar provinsi Hubei.
Pendanaan
Dana Sains Nasional untuk Cendekiawan Muda yang Terhormat, Institut Nasional Ilmu Kedokteran Umum, dan Komisi Eropa Cakrawala 2020.
Pengantar
Sejak Desember 2019, peningkatan jumlah kasus pneumonia atipikal yang disebabkan oleh coronavirus 2 sindrom pernapasan akut (SARS-CoV-2) telah dilaporkan di Wuhan, sebuah kota di provinsi Hubei di Cina.1 Pada 17 Februari 2020, 72.436 kasus penyakit coronavirus 2019 (COVID-19), termasuk 1.868 kematian, telah dilaporkan di daratan Cina.2 Wabah ini sekarang telah menyebar ke 198 negara, wilayah, atau wilayah di luar China.3 Pada 30 Januari 2020, WHO menyatakan Wabah COVID-19 darurat kesehatan masyarakat yang menjadi perhatian internasional.4
Laporan awal5 tentang epidemiologi wabah COVID-19 termasuk analisis dari 425 kasus pertama yang terdeteksi di Wuhan hingga 22 Januari 2020. Sejak itu, dinamika temporal dan penyebaran spasial COVID-19 telah berubah, dengan 17% dari kasus yang dilaporkan di luar Hubei di daratan Cina pada 17 Februari. Di provinsi di luar Hubei, epidemi COVID-19 ditandai dengan campuran transmisi lokal dan impor kasus dari Hubei.6 Laporan6 berdasarkan 44.672 kasus yang dikonfirmasi terdeteksi di daratan Cina hingga 11 Februari, memberikan deskripsi karakteristik kasus COVID-19 untuk daratan Cina dan di Hubei. Hingga saat ini, hanya ada sedikit informasi tentang fitur epidemiologi dan dinamika transmisi dari wabah COVID-19 di luar Hubei. Informasi ini akan sangat penting untuk menginformasikan kebijakan intervensi secara real-time, tidak hanya untuk Cina, tetapi juga untuk negara-negara lain dengan transmisi COVID-19.
Kami bertujuan untuk menggambarkan karakteristik epidemiologi dari wabah COVID-19 50 hari setelah diakui di provinsi-provinsi Cina di luar Hubei. Kami juga memperkirakan perubahan dalam interval waktu-ke-peristiwa utama dan jumlah reproduksi untuk menilai apakah langkah-langkah kontrol ketat yang diterapkan di Cina telah berhasil memperlambat transmisi.
Metode
Definisi dan pengawasan kasus
Sejak wabah COVID-19 pertama kali terdeteksi di Wuhan, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok (CDC Cina) telah meluncurkan sistem pengawasan baru, pertama di Wuhan, kemudian diperluas ke seluruh negara, untuk mencatat informasi tentang COVID-19 kasus (apendiks pp 2-3) .1, 5 Pedoman diagnosis dan pengobatan pasien dengan pneumonia yang terinfeksi coronavirus (NCIP) yang baru diterbitkan, dengan yang pertama diterbitkan pada 15 Januari 2020, mendefinisikan kasus NCIP yang dicurigai sebagai pneumonia yang memenuhi kriteria klinis spesifik dan memiliki hubungan epidemiologis dengan pasar grosir makanan laut Huanan di Wuhan atau telah melakukan perjalanan ke Wuhan dalam 14 hari sebelum timbulnya gejala (Lampiran hal. 2-3). Dua versi pedoman berikutnya (yang pertama dikeluarkan pada 18 Januari dan yang kedua pada 22 Januari) menghilangkan kriteria klinis tidak ada perbaikan atau penurunan gejala setelah 3 hari pengobatan antibiotik untuk mempercepat identifikasi kasus. Selain itu, hubungan epidemiologis direvisi untuk memasukkan riwayat perjalanan ke Wuhan, kontak langsung dengan pasien dari Wuhan yang mengalami demam atau gejala pernapasan dalam waktu 14 hari sebelum timbulnya gejala, atau bagian dari cluster COVID-19. Dalam versi keempat pedoman (dikeluarkan pada 27 Januari), kriteria klinis diperluas untuk memenuhi dua dari tiga kriteria klinis yang tersisa (yaitu, demam, temuan radiografi pneumonia, dan jumlah sel darah putih normal atau berkurang atau berkurangnya limfosit dihitung pada tahap awal penyakit), dan kriteria epidemiologis ditambahkan (terkait dengan kasus COVID-19 yang dikonfirmasi). Dalam versi kelima yang dikeluarkan pada 4 Februari, kasus-kasus yang didiagnosis secara klinis didefinisikan sebagai kasus yang diduga dengan temuan radiografi pneumonia, yang akan digunakan secara eksklusif di Hubei.
Studi ini disetujui oleh dewan peninjau kelembagaan dari Sekolah Kesehatan Masyarakat, Universitas Fudan (Shanghai, Cina). Semua data dikumpulkan dari sumber yang tersedia untuk umum. Data diidentifikasikan, dan informed consent dilepaskan.
Sumber dan pengumpulan data
Read More...
Latar Belakang
Epidemi penyakit coronavirus 2019 (COVID-19), yang disebabkan oleh coronavirus 2 sindrom pernapasan akut (SARS-CoV-2), dimulai di kota Wuhan, provinsi Hubei, pada bulan Desember, 2019, dan telah menyebar ke seluruh Tiongkok. Memahami epidemiologi yang berkembang dan dinamika transmisi wabah di luar Hubei akan memberikan informasi yang tepat waktu untuk memandu kebijakan intervensi.
Metode
Kami mengumpulkan informasi individual dari sumber publik resmi tentang kasus yang dikonfirmasi laboratorium yang dilaporkan di luar Hubei di daratan Cina untuk periode 19 Januari hingga 17 Februari 2020. Kami menggunakan tanggal revisi keempat definisi kasus (27 Jan) untuk membagi epidemi menjadi dua periode waktu (24 Desember - 27 Jan, dan 28 Jan - 17 Februari) sebagai tanggal timbulnya gejala. Kami memperkirakan tren dalam karakteristik demografis kasus dan interval waktu-ke-peristiwa utama. Kami menggunakan pendekatan Bayesian untuk memperkirakan dinamika jumlah reproduksi bersih (Rt) di tingkat provinsi.
Temuan
Kami mengumpulkan data pada 8579 kasus dari 30 provinsi. Usia rata-rata kasus adalah 44 tahun (33-56), dengan peningkatan proporsi kasus pada kelompok usia yang lebih muda dan pada orang tua (yaitu, usia> 64 tahun) ketika epidemi berkembang. Waktu rata-rata dari onset gejala sampai masuk rumah sakit menurun dari 4 · 4 hari (95% CI 0 · 0–14 · 0) untuk periode 24 Desember hingga 27 Januari, menjadi 2 · 6 hari (0 · 0–9 · 0 ) untuk periode 28 Januari hingga 17 Februari. Masa inkubasi rata-rata untuk seluruh periode diperkirakan 5 · 2 hari (1 · 8-12 · 4) dan interval serial rata-rata pada 5 · 1 hari (1 · 3– 11 · 6). Dinamika epidemi di provinsi di luar Hubei sangat bervariasi tetapi secara konsisten mencakup campuran impor kasus dan transmisi lokal. Kami memperkirakan bahwa epidemi itu bertahan sendiri selama kurang dari 3 minggu, dengan rata-rata Rt mencapai puncak antara 1 · 08 (95% CI 0 · 74-1 · 54) di kota Shenzhen di provinsi Guangdong dan 1 · 71 (1 · 32) –2 · 17) di provinsi Shandong. Di semua lokasi di mana kami memiliki cakupan data Rt yang cukup, Rt diperkirakan berada di bawah ambang epidemi (yaitu, <1) setelah 30 Januari.
Penafsiran
Perkiraan kami tentang periode inkubasi dan interval serial serupa, menunjukkan puncak awal infeksi, dengan kemungkinan penularan sebelum timbulnya gejala. Hasil kami juga menunjukkan bahwa, ketika epidemi berkembang, individu yang terinfeksi lebih cepat diisolasi, sehingga memperpendek jendela penularan di masyarakat. Secara keseluruhan, temuan kami menunjukkan bahwa tindakan pencegahan yang ketat, pembatasan gerakan, dan peningkatan kesadaran penduduk mungkin telah berkontribusi untuk mengganggu transmisi lokal SARS-CoV-2 di luar provinsi Hubei.
Pendanaan
Dana Sains Nasional untuk Cendekiawan Muda yang Terhormat, Institut Nasional Ilmu Kedokteran Umum, dan Komisi Eropa Cakrawala 2020.
Pengantar
Sejak Desember 2019, peningkatan jumlah kasus pneumonia atipikal yang disebabkan oleh coronavirus 2 sindrom pernapasan akut (SARS-CoV-2) telah dilaporkan di Wuhan, sebuah kota di provinsi Hubei di Cina.1 Pada 17 Februari 2020, 72.436 kasus penyakit coronavirus 2019 (COVID-19), termasuk 1.868 kematian, telah dilaporkan di daratan Cina.2 Wabah ini sekarang telah menyebar ke 198 negara, wilayah, atau wilayah di luar China.3 Pada 30 Januari 2020, WHO menyatakan Wabah COVID-19 darurat kesehatan masyarakat yang menjadi perhatian internasional.4
Laporan awal5 tentang epidemiologi wabah COVID-19 termasuk analisis dari 425 kasus pertama yang terdeteksi di Wuhan hingga 22 Januari 2020. Sejak itu, dinamika temporal dan penyebaran spasial COVID-19 telah berubah, dengan 17% dari kasus yang dilaporkan di luar Hubei di daratan Cina pada 17 Februari. Di provinsi di luar Hubei, epidemi COVID-19 ditandai dengan campuran transmisi lokal dan impor kasus dari Hubei.6 Laporan6 berdasarkan 44.672 kasus yang dikonfirmasi terdeteksi di daratan Cina hingga 11 Februari, memberikan deskripsi karakteristik kasus COVID-19 untuk daratan Cina dan di Hubei. Hingga saat ini, hanya ada sedikit informasi tentang fitur epidemiologi dan dinamika transmisi dari wabah COVID-19 di luar Hubei. Informasi ini akan sangat penting untuk menginformasikan kebijakan intervensi secara real-time, tidak hanya untuk Cina, tetapi juga untuk negara-negara lain dengan transmisi COVID-19.
Kami bertujuan untuk menggambarkan karakteristik epidemiologi dari wabah COVID-19 50 hari setelah diakui di provinsi-provinsi Cina di luar Hubei. Kami juga memperkirakan perubahan dalam interval waktu-ke-peristiwa utama dan jumlah reproduksi untuk menilai apakah langkah-langkah kontrol ketat yang diterapkan di Cina telah berhasil memperlambat transmisi.
Metode
Definisi dan pengawasan kasus
Sejak wabah COVID-19 pertama kali terdeteksi di Wuhan, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok (CDC Cina) telah meluncurkan sistem pengawasan baru, pertama di Wuhan, kemudian diperluas ke seluruh negara, untuk mencatat informasi tentang COVID-19 kasus (apendiks pp 2-3) .1, 5 Pedoman diagnosis dan pengobatan pasien dengan pneumonia yang terinfeksi coronavirus (NCIP) yang baru diterbitkan, dengan yang pertama diterbitkan pada 15 Januari 2020, mendefinisikan kasus NCIP yang dicurigai sebagai pneumonia yang memenuhi kriteria klinis spesifik dan memiliki hubungan epidemiologis dengan pasar grosir makanan laut Huanan di Wuhan atau telah melakukan perjalanan ke Wuhan dalam 14 hari sebelum timbulnya gejala (Lampiran hal. 2-3). Dua versi pedoman berikutnya (yang pertama dikeluarkan pada 18 Januari dan yang kedua pada 22 Januari) menghilangkan kriteria klinis tidak ada perbaikan atau penurunan gejala setelah 3 hari pengobatan antibiotik untuk mempercepat identifikasi kasus. Selain itu, hubungan epidemiologis direvisi untuk memasukkan riwayat perjalanan ke Wuhan, kontak langsung dengan pasien dari Wuhan yang mengalami demam atau gejala pernapasan dalam waktu 14 hari sebelum timbulnya gejala, atau bagian dari cluster COVID-19. Dalam versi keempat pedoman (dikeluarkan pada 27 Januari), kriteria klinis diperluas untuk memenuhi dua dari tiga kriteria klinis yang tersisa (yaitu, demam, temuan radiografi pneumonia, dan jumlah sel darah putih normal atau berkurang atau berkurangnya limfosit dihitung pada tahap awal penyakit), dan kriteria epidemiologis ditambahkan (terkait dengan kasus COVID-19 yang dikonfirmasi). Dalam versi kelima yang dikeluarkan pada 4 Februari, kasus-kasus yang didiagnosis secara klinis didefinisikan sebagai kasus yang diduga dengan temuan radiografi pneumonia, yang akan digunakan secara eksklusif di Hubei.
Studi ini disetujui oleh dewan peninjau kelembagaan dari Sekolah Kesehatan Masyarakat, Universitas Fudan (Shanghai, Cina). Semua data dikumpulkan dari sumber yang tersedia untuk umum. Data diidentifikasikan, dan informed consent dilepaskan.
Sumber dan pengumpulan data
Read More...